Столкнулся с прикольной проблемой. У пользователя во время работы с приложением, развернутым по ClickOnce, отключили свет. После этого приложение перестало запускаться. Удаление приложения и повторное развертывание не помогло.
Так вот, приложения ClickOnce устанавливаются в папку со странным именем по пути:
C:\Users\<Имя_пользователя>\AppData\Local\Apps\2.0\
Так вот, проблему полечило удаление приложения и этих странных папок. Вот, пусть здесь лежит, вдруг мне или кому-нибудь еще пригодится.